多囊卵巢治疗方法主要有西医、中医多种不同的疗法。简单来说，一种是药物治疗，可用西药和中药，另一种是手术治疗。一般药物治疗效果不是很理想，可采用微创手术治疗，创伤小，恢复也快。如果多囊卵巢综合症的症状仍不算太严重，那也可以采取药物治疗的方式缓解病情。
雄激素过多是多囊卵巢综合征的基本特征，药物治疗可以对抗雄激素的作用，促使卵巢排卵。使用的药物主要是口服避孕药，药物同时可以调整月经周期。一般服用3-6个月左右，经过激素所平检测正常后就可以停止服药。可口服克罗米芬进行排卵治疗，低剂量能促进垂体前叶分泌促性腺激素，从而诱发排卵，有月经者自经期第5日开始每日1次50mg，连服5日；无月经者任意1日开始，每日1次50mg，连服5日。一般在服药后7日左右排卵，3周后自然行经。连服3个周为一个疗程。闭经的多囊卵巢病人可先用黄体酮，在撤退性出血第5天开始再服用克罗米芬。
中医治疗多囊卵巢综合症上以补肾助阳或滋肾养阴、益气健脾为主，兼以疏肝理气、活血化瘀、燥湿化痰、软坚散结等法。中药的治疗对身体毒副作用比较小，另外中医药治疗具有辨证灵活，调换组方自由度大，因病施治，因人施治，标本兼治，愈后不复发，具有治本除根的优势。
