天才外科医生大门未知子造访纽约的中华料理店时，碰到店中一位孕妇顾客突发急病。未知子经诊察判断病人必须立即进行手术。另一个顾客久保东子说她担任清洁工的医院就在附近。病人被送到医院，经过未知子快速精准的处置，终于转危为安。
看到未知子处置病患的过程后，东子对她的医术十分感兴趣。而未知子也与对日本大学医院的各种腐败现象深恶痛绝的东子意气相投。不久，未知子接到日本医学界最高峰——东帝大学医院的邀请。实际上，因为各种丑闻和医疗事故、内部斗争，如今的东帝大学医院名声一落千丈。为了重新确立医院的品牌形象，未知子的宿敌蛭间重胜用诡计赶走了院长久保茂，坐上了院长宝座。
未知子虽不情愿，却不得不深入腐败横行的东帝大医院。然而，她在那里意外地与东子重逢。原来，东子借她哥哥、前任院长久保茂之力，成为东帝大学医院的新任副院长。力主聘请未知子的铁腕人物正是她。东子诚恳地请求未知子和她一起扫清大学医院的“污秽”。
外科医大门未知子4剧照
而未知子却觉得此事有些可疑。正在这时，患有很难摘除的脊椎癌的IT公司社长一木淳决定在东帝大学医院接受手术。主刀医生就是从纽约聘来的超级医生北野亨。未知子提出异议，而自信满满的北野寸步不让，他要进行日本外科医大门未知子4第一场使用3D打印技术的脊椎手术。但是，就在手术前夕，无论是对于东帝大还是患者一木本人来说都不愿看到的紧急情况发生了。
外科医大门未知子4第2集剧情介绍东帝大学医院院长蛭间打出了以富有阶层对目标进行特殊化服务的品牌战略，指示医生们仔细挑选病人。这时，拿着介绍信的二冈日出夫和妻子千代子来到医院。
内科部长黄川田高之见二人看起来很穷，就以介绍他们到下属分院为借口拒绝收治。正巧此时国会议员金本洋二为了检查身体秘密入院。蛭间意气风发地率众迎接这位请都请不来的富贵患者。然而，不久后，传出了金本在政治资金上有问题的流言。
蛭间害怕惹祸上身、影响医院形象，于是，按他的指示，黄川田委婉地请金本转到分院去，却被对方断然拒绝。就在这个时候，只关心救治患者的大门未知子诊断出二冈患有多发大肠癌，如果不马上手术就有生命危险。然而，二冈坚持要回家，不做手术。实际上，二冈是虹川村的村长。
他一心一意为村民服务，带领村子登上了全国市町村幸福度排行榜外科医大门未知子4第一名，而其本人却是“日本最穷村长”，因而备受注目。一个是拒绝手术执意出院的“清贫政治家”，一个是无论如何都要赖在医院的“黑金政治家”。处在两个极端的患者都落到了“东帝大学医院”。
蛭间听说了二冈的真实身份后，决定由黄川田率领的内科负责其治疗。与此同时，为避风头才入院的金本也被诊断出有严重的大肠癌。结果，金本的手术由未知子负责。而未知子接受了二冈“最后的愿望”的委托，开始在医院私自为二冈进行手术。然而，在有切除可能的肿瘤的一部分还残留在患者体内的情况下，手术就结束了。
外科医大门未知子4第3集剧情介绍未知子捡到一个钱包并交给了警察。失主须山三佐江来到东帝大医院致谢。作为谢礼，三佐江决定预约最高级别的体检。但是，东帝大医院最高级的体检是超VIP待遇的三日综合体检，价格非常昂贵。
副院长久保东子恼恨未知子随便给素昧平生的三佐江预约。考虑到三佐江可能会不付钱，她命令未知子负责监督三佐江。颇觉麻烦的未知子与外科部长西园寺猛一起来到三佐江的病房。不料，一看到三佐江，西园寺就脸色大变。
原来，西园寺在20年前曾为三佐江做过胃溃疡手术，而且他俩曾经是情人关系。这时，更令人惊讶的事发生了。根据检查结果，三佐江体内发现了疑似为大型肿瘤的阴影。这是一个即便是像未知子这样的天才医生，如果不做开腹手术也连正式病名都不知道的前所未有的大型肿瘤。万幸的是，开腹手术证明了此阴影并非肿瘤。
然而，发现了所谓大型阴影的真相后，蛭间却慌了神。他确信那是西园寺过去的医疗失误，于是命令中止手术。最终，手术被强行取消。未知子不接受这样的结果，不顾医院方面的意见，把真相告诉了三佐江。万没想到的是，三佐江听后不但没有生气，反而笑了起来，她的心思让人猜不透。而就在重新仔细检查患者的片子时，未知子的脸上忽然浮现出惊恐的表情。
外科医大门未知子4第4集剧情介绍以美貌著称于世的美人姐妹组合“四叶姐妹”来到东帝大学医院。虽然她们是秘密入院，但是流言很快在医院中散播开来。不知详情的医们全都开始坐立不安。
这时，到四叶姐妹所在的特别病房窥探的大门未知子却简直不敢相信自己看到的情景。在病房里的是美丽的姐姐四叶美丽和胖得不成样子的妹妹四叶美音。实际上，姐妹俩住院的目的就是治疗美音的肥胖症。然而，副院长久保东子独断专行，把外科医生原守从金泽叫到总院，让他进行外科手术。
被东子的花言巧语打动的原守充满干劲儿，想展示一下拿手的技艺。不料，他遭到老相识未知子、加地秀树和做实习医生时的同期北野等人的轻视。与此同时，未知子碰到从病房里跑出来的美音，确认她的情况有异常。
经过紧急检查，美音肥胖的原因终于找到了。而未知子发现美丽也患有疾病。得知了美丽心中隐藏着的想法后，未知子宣布自己要负责姐妹二人的手术。院长蛭间想借四叶姐妹的人气炒热医院，所以决定两台手术同时进行。未知子强烈反对，因为她无法分身同时进行手术。但蛭间却坚持哪个都不能放弃。未知子只得申请助手。
